Развитие кафедры анатомии
После отставки Е. Ф. Аристова кафедру анатомии поочередно занимали профессора: П. Ф. Лесгафт в 1869 - 1871 гг., Д. С. Ермолаев в 1872 - 1891 гг., A.M. Фортунатов в 1891 - 1904 гг., В. Н. Тонков в 1905 - 1915 гг., Н. Д. Бушмакин в 1916 - 1918 гг. Центральными фигурами казанской анатомической школы были Петр Францевич Лесгафт (1837 - 1909) и Владимир Николаевич Тонков (1872 - 1954).
Развитие кафедры физиологии
Кафедра гистологии и эмбриологии
Датой основания кафедры гистологии и эмбриологии следует считать 9 марта 1864 г., когда приват-доцентом по кафедре гистологии был утвержден Константин Захарович Кучин (1834 - 1895). С 1869 по 1871 г. кафедру возглавлял профессор Александр Ефимович Голубев (1837 - 1926), покинувший Казанский университет в связи с «делом Лесгафта».
Кафедра медицинской химии
Днем рождения кафедры медицинской химии следует считать 21 октября 1863 г., когда экстраординарным профессором Казанского университета по кафедре медицинской химии и физики был избран Александр Яковлевич Данилевский (1838 -1923).
Кафедра фармакологии
С 1864 по 1868 г. курс фармакологии по совместительству читал биохимик А. Я. Данилевский. В 1869 г. кафедру фармакологии возглавил Иван Михайлович Догель (1830— 1916). Он справедливо считается классиком отечественной медицины, ярчайшим представителем казанской медицинской школы.
Кафедра патологической анатомии
Хотя преподаванию патологической анатомии в 40 - 50-х гг. много внимания уделял профессор физиологической анатомии Е. Ф. Аристов, официальным днем рождения кафедры патологическая анатомии можно считать 21 октября 1863 г., когда доцентом по кафедре патологической анатомии был утвержден Александр Васильевич Петров (1837—1885) и она начала свое самостоятельное существование. Кафедра расположилась на втором этаже анатомического театра.
Кафедра общей патологии
Развитие кафедры судебной медицины
По уставу 1863 г., судебная медицина преподавалась совместно с гигиеной, и лишь через шесть лет этим дисциплинам стали обучать на самостоятельных кафедрах. Де-факто это произошло, когда в 1869 г. экстраординарным профессором судебной медицины избрали Ивана Михайловича Гвоздева (1827—1896), а де-юре годом основания кафедры судебной медицины считается 1871 г., когда он был избран ординарным профессором.
Кафедра гигиены
В 1864 г. кафедру «Судебная медицина с токсикологией, гигиена и медицинская полиция» в Казанском университете возглавил Аркадий Иванович Якобий (1827— 1907), окончивший в 1847 г. физико-математический факультет Казанского университета. Медицинское образование он получил в Петербургской медико-хирургической академии и Вюрцбургском университете. А. И. Якобий сразу же стал настойчиво добиваться выделения гигиены как особой дисциплины, формирующей научные представления о здоровье населения, о возможностях его регулирования деятельностью самого государства.
Кафедра фармакогнозии и фармации
Преподавание фармакогнозии и фармации осуществлялось с начала деятельности медицинского факультета. Согласно университетским уставам 1804 и 1835 гг., данный курс читался (правда, не всегда регулярно) на кафедре врачебного веществословия. Согласно уставу 1863 г. была предусмотрена отдельная кафедра фармакогнозии и фармации. Однако она так и не была организована, и предмет читал доцент Роберт Андреевич Лангель (1821 —1897).